Αποστολή της Σχολής ΜΗΠΕΡ είναι η εκπαίδευση επιστημόνων Διπλωματούχων Μηχανικών ικανών να συμβάλλουν στη μέτρηση, παρακολούθηση, αξιολόγηση και αντιμετώπιση των προβλημάτων που προκαλεί η ανθρώπινη δραστηριότητα, όταν συνεπάγεται μεταβολές και αλλοιώσεις στο περιβάλλον. Παράλληλα, η Σχολή ΜΗΠΕΡ έχει ισχυρή διεθνή παρουσία στην έρευνα με στόχο την ανάπτυξη καινοτόμων λύσεων στα τρέχοντα περιβαλλοντικά προβλήματα.